本发明提供了川芎嗪和甘露糖醛酸的组合物在用于制备治疗血栓性疾病和神经系统疾病的药物中的应用，本发明经过试验结果证明：相比于川芎嗪和甘露糖醛酸单独给药，川芎嗪和甘露糖醛酸联合给药后，产生了显著优于单独给药的协同增效抵抗血小板聚集的作用，本发明表明联合复配后川芎嗪与甘露糖醛酸可从不同的途径发挥作用，从而协同发挥更强的预防和治疗血栓性疾病的功效。本发明证明可以将川芎嗪与甘露糖醛酸联合复配后用于制备治疗血栓性疾病和血栓导致的中枢神经系统失常及循环障碍中的应用，具有良好的市场应用前景。