本实用新型公开了一种多层隧道式微波兽药干燥机，属于兽药干燥机领域，多层隧道式微波兽药干燥机包括干燥筒以及空气加热系统，所述干燥筒固定于两端支架之间，所述空气加热系统通过通风管与所述干燥筒相连，所述通风管贯穿所述干燥筒内部，所述干燥筒内部设置有导料槽，所述导料槽紧贴所述干燥筒内壁呈螺旋状向下延伸，所述干燥筒底端连接通料管，所述通料管末端位于集料槽上方。本实用新型公开的一种多层隧道式微波兽药干燥机，通过热风对于兽药的作用，加速兽药的干燥，减少干燥筒的数量，节省了干燥机所占空间。