本发明公开了一种长链非编码RNA及其干扰RNA在治疗动脉粥样硬化中的应用。本发明通过对动脉粥样硬化小鼠模型的主动脉组织进行高通量测序，发现了一种长链非编码RNA(lncRNA)分子在正常与晚期动脉粥样硬化小鼠主动脉组织中表达显著差异，同时该lncRNA分子在动脉粥样硬化组织中的高表达，将该lncRNA分子命名为lncRNA‑AFIAR。实验证明lncRNA‑AFIAR具有增强巨噬细胞增殖、抑制巨噬细胞凋亡等功能，参与了促进动脉粥样硬化的进展这一过程。通过对lncRNA‑AFIAR进行抑制可以达到抑制巨噬细胞增殖、减少斑块形成进而达到抑制AS的进展的目的。因此，本发明的提出为诊疗动脉粥样硬化提供了新的分子标记和干预靶点，也为动脉粥样硬化的治疗提供了新的技术手段。