本申请提供了一种对目标蛋白的稳定性和亲和力进行优化的方法，所述方法包括如下步骤：(1)构建目标蛋白表达基因；(2)将所述目标蛋白表达基因在CHO‑puro‑TR细胞系中表达；(3)将表达目标蛋白表达基因的CHO‑puro‑TR细胞系在第一温度下培养诱导体细胞高频突变以获得含有目标蛋白突变库的细胞；(4)将步骤(3)获得的含有目标蛋白突变库的细胞在第二温度下培养一段时间；(5)对步骤(4)得到的细胞在目标蛋白的配体存在的条件下，在第三温度下孵育一段时间，所述目标蛋白的配体可以被标记物标记；(6)对步骤(5)培养得到的细胞进行流式分选，筛选含有稳定性和亲和力提高的目标蛋白的细胞。