本发明公开了一种环糊精葡萄糖基转移酶突变体及其应用，属于酶工程和微生物工程技术领域。本发明CGTase突变体对长链糖基化染料木素的产物特异性高；利用本发明的CGTase突变体A156V/L174P、A156V/L174P/A166Y、A156V/L174P/A166V、A156V/L174P/A166G和A156V/L174P/A166K分别以麦芽糊精作为糖基供体，以染料木素作为糖基受体生产长链糖基化染料木素的产量较利用野生型环糊精葡萄糖基转移酶以麦芽糊精作为糖基供体，以染料木素作为糖基受体生产长链糖基化染料木素的产量分别提高了62.5％、165％、112.5％、112.5％和59.4％。