本发明公开了一种小球藻发酵提取物及其制备方法。本发明利用植物乳杆菌等菌种的培养液对小球藻粉进行液体发酵培养，得发酵产物，发酵产物经过离心、过滤、除菌，得小球藻粉发酵提取物。所述方法反应条件温和，制备工艺简单，无添加任何化学成分。通过实验证明，上述方法制备的小球藻粉发酵提取物，富含蛋白质、粗多糖、总氨基酸和叶黄素等功效成分，具良好的抗自由基、改善皮肤刺激及抗衰老等功效，且生物安全性高，可广泛应用到的各类化妆品中。