本发明提供一种基于知识图谱的伤寒辨证推理系统，能够将伤寒的诊疗模式运用到现代智能辅助诊疗系统中来。所述系统包括：分析模块，用于对伤寒论和有关伤寒论方证对应论著进行分析，得到基于六经和多纲的辨证要素；构建模块，用于根据伤寒论、有关伤寒论方证对应论著及得到的基于六经和多纲的辨证要素，对伤寒体系知识进行解析，将伤寒体系知识以节点的形式表示并将节点分层，并确定层次节点间的关系，构建伤寒论体系知识图谱；推理模块，用于在构建的伤寒论体系知识图谱的基础上，构建基于中医经方医案的深度学习模型和基于中医知识的匹配模型对输入的一组症状进行方剂推理。本发明涉及中医、计算机技术领域。