本申请公开的双层包装理料堆垛系统，与现有技术相比，包括：双层送纸机构和顶纸机构；所述双层送纸机构用于向所述顶纸机构输送双层的包装纸巾；所述顶纸机构用于顶升由所述双层送纸机构输送堆积两层的包装纸巾；位于所述顶升机构一侧的第一接料机构，以及位于所述顶升机构另一侧的第二接料机构；所述第一接料机构和所述第二接料机构用于接收所述顶纸机构顶升的纸巾。相较于现有技术而言，其能够实现通过双层送料将单次包装所需的纸巾数量单独送至顶纸机构，继续由顶纸机构将堆积两层的纸巾向上顶送至下一个工位处，提高包装作业效率。